fungsi dari vektor ekspresi

a.       Ori (origin of replication), yaitu situs untuk memulai replikasinya sendiri, sehingga dalam sel mampu bereplikasi/menggandakan diri sendiri

b.      Operator (o), mempunyai fungsi yaitu mengatur gen struktur menjadi aktif atau dalam keadaan terbuka dan menjadi tidak aktif atau dalam keadaan tertutup.

c.       Promoter (p)

Agar molekul DNA dapat digunakan sebagai cetakan dalam sintesis RNA, kedua untainya harus dipisahkan satu sama lain di tempat-tempat terjadinya penambahan basa pada RNA. Selanjutnya, begitu penambahan basa selesai dilakukan, kedua untai DNA segera menyatu kembali. Pemisahan kedua untai DNA pertama kali terjadi di suatu tempat tertentu, yang merupakan tempat pengikatan enzim RNA polimerase di sisi 5’ (upstream) dari urutan basa penyandi (gen) yang akan ditranskripsi. Tempat ini dinamakan promoter

d.      Marker seleksi berguna untuk proses seleksi, yaitu tahap untuk menyeleksi plasmid yang membawa DNA sisipan (rekombinan) dari plasmid yang tidak disisipi DNA asing. Marker seleksi yang umum adalah gen resistensi terhadap antibiotika, misalnya ampisilin atau tetrasiklin

e.       Situs kloning adalah tempat/lokasi dimana fragmen DNA yang akan diklon/digandakan dimasukkan/ disisipkan untuk kemudian digandakan oleh plasmid.
situs kloning adalah satu segmen pada plasmid yang panjangnya beberapa puluh sampai ratusan pasang basa yang terdapat sekuens pengenal untuk beberapa enzim restriksi.

Ribosom binding site berfungsi untuk menyediakan sinyal yang diperlukan untuk terjemahan mRNA yang berasal dari gen.